El brote de peste comienza a remitir en la ciudad. El Gran Inquisidor entrega a Mateo su orden de libertad. Mateo ha resuelto el caso. Como consecuencia de la investigación, son detenidos por la Inquisición algunos protestantes que están desviando metales preciosos a Flandes para financiar la guerra contra el Imperio Español. Se celebra un auto de fe en el que los acusados son condenados a morir en la hoguera. El Cabildo se muestra inflexible con Teresa. Deberá nombrar a un hombre responsable de la fábrica, en caso contrario se cerrará definitivamente y ella será encarcelada. Mientras tiene lugar el auto de fe, Mateo descubre que Ledesma no era el verdadero asesino. Esta certeza llevará a Mateo a una acción desesperada en la que está a punto de perder la vida.